两者的主管部门不一样。
一般政府采购专家库归财政厅管，综合评标专家库归发改委管，综合库适用于各种项目。两者的专家库成员也会略有不同，但可以存在交叉，采购库内的专家可能在某一领域比较有权威，例如药品采购，大型设备采购等方面，但9综合库的专家涵盖面更广。
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